Glossary entry (derived from question below)
English term or phrase:
set from default 1.7 to 2
Russian translation:
установили вместо значения по умолчанию 1,7 значение 2
Added to glossary by
Nitrogen
Nov 30, 2018 14:18
5 yrs ago
English term
set from default 1.7 to 2
English to Russian
Science
Biology (-tech,-chem,micro-)
секвенирование
For TCR analysis, we developed a new bioinformatic pipeline rpsTCR for reconstructing and extracting TCR sequences, especially TCR-CDR3 sequences from random priming short RNA sequencing reads. The rpsTCR took paired- and single-end short reads and maps these reads to mouse or human genomes and transcriptomes, but not TCR gene loci and transcripts using TopHat (Bioinformatics 25, 1105–1111 (2009)) with default parameters. Mapped reads were discarded and unmapped reads are recycled for extraction of TCR sequences. Low quality nucleotides in the unmapped reads were trimmed. Then reads with length less than 35bp were filtered out using HTQC toolkit (Bioinformatics 14, 33 (2013). QC passed short reads was assembled into longer reads using iSSAKE (Bioinformatics 25, 458–464 (2009)) default setting. TCRklass (J Immunol 194, 446–454 (2015)) was used to identify CDR3 sequences with Scr (conserved residue support score) ***set from default 1.7 to 2***. A targeted TCR-seq data from a healthy human PBMC samples was used as a positive control to evaluate whether the extra steps introduced to the pipeline resulted in higher false positive or false negative rates comparing to TCRklass alone.
Proposed translations
(Russian)
4 | установили вместо значения по умолчанию 1,7 значение 2 | Tatiana Nikitina |
3 +1 | см. | Igor Andreev |
Proposed translations
9 mins
Selected
установили вместо значения по умолчанию 1,7 значение 2
Они изменили в ПО значение оценки Scr с 1,7 (установленного по умолчанию) на 2.
4 KudoZ points awarded for this answer.
Comment: "Большое спасибо!"
+1
15 mins
см.
... при значении Scr, заданном в диапазоне от 1,7 (по умолчанию) до 2.
В статье, на которую ссылается текст http://www.jimmunol.org/content/194/1/446.full, говорится
The identified CDR3 are filtered by a range of Nmk and Scr (2–7 for Nmk, 1.0–2.9 for Scr), to determine the best Nmk and the Scr cutoff value for CDR3 identification, and a series of precision and recall rates was calculated on these cutoff values.
Т.е. для отбора используется диапазон значений этого параметра, вопрос только, к чему относится "по умолчанию" - ко всему диапазону или действительно только к первому значению (как это следует из англ. оригинала)
В статье, на которую ссылается текст http://www.jimmunol.org/content/194/1/446.full, говорится
The identified CDR3 are filtered by a range of Nmk and Scr (2–7 for Nmk, 1.0–2.9 for Scr), to determine the best Nmk and the Scr cutoff value for CDR3 identification, and a series of precision and recall rates was calculated on these cutoff values.
Т.е. для отбора используется диапазон значений этого параметра, вопрос только, к чему относится "по умолчанию" - ко всему диапазону или действительно только к первому значению (как это следует из англ. оригинала)
Discussion